Gerry Conlon je problémový mladík. Žije v Belfastu v sedmdesátých letech, v obzvlášť výbušné době, kdy se anglické jednotky mnohdy marně pokoušejí bojovat proti příslušníkům IRA. Gerry nemá nejlepší vztahy s otcem, který ho nikdy nedokázal pochválit, a tak se z trucu dal na drobné krádeže. S kamarádem Dannym právě kvůli další krádeži nechtěně upoutají pozornost Britů na úkryt zbraní příslušníků IRA, což může být nebezpečné. Otec usoudí, že by měl Gerry co nejdřív zmizet. Gerry tedy odplouvá do Anglie, do Guilfordu, kde má tetu a kde by si měl podle otce najít práci.. Na palubě lodi se náhodně setká se spolužákem Paulem Hillem. Oba mladíci se zprvu usadí ve squattu, kde žije skupina hippies a také Paddy Gerryho kamarád Armstrong. Jejich pobyt mezi hippies ale nedělá dobrotu, a tak mladíci odcházejí. Gerry přespí několikrát u tety Annie, pak se s Paulem potulují a nakonec skončí na jednu noc v hotelu, kde okradou prostitutku. Pak se Gerry vrací domů. Právě v době, kdy se s Paulem povalovali na lavičce se starým bezdomovcem, ale kdosi vyhodil do povětří hospodu v Guilfordu. Při atentátu zemřelo pět lidé a mnoho dalších je zraněných. Podezření ihned padne na IRA a souhrou okolností se stanou podezřelými oba mladíci. Pro Gerryho si záhy přichází policie a je vyslýchán v rámci nově přijatého zákona o protiteroristické prevenci. Je surově bit, mučen a zastrašován. Pak se dozví, že zdeptaný Paul už podepsal přiznání. Když mu jeden obzvlášť cynický vyšetřovatel pohrozí, že mu zabije otce, zhroutí se a podepíše také. To má ovšem za následek zatčení nejen jeho tety Annie, ale i otce Guiseppa Conlona, který se mezitím vydal do Anglie, aby synovi pomohl. Otec a syn se tak sejdou v jedné cele... Gerry, Paul a dva lidé ze squattu - Paddy Armstrong a Carole Richardsonová - spolu s tetou Annie Maguireovou a jejími dvěma syny se ocitají před soudem. Policisté zkonstruovali proces, v němž jsou čtyři mladí lidé obviněni z krvavého atentátu, otec Guiseppe a teta Annie pak z toho, že vyrábějí výbušniny a poskytují "teroristům" zázemí. Gerry se u soudu hájí tím, že v době atentátu byli s Paulem v parku, kde na lavičce mluvili se starým bezdomovcem. To je ovšem policii jen k smíchu. Nakonec padne verdikt: všichni obžalovaní jsou vinni ve všech bodech obžaloby. Gerry je odsouzen na doživotí, jeho teta na 14 let a otec na 20 let. Guiseppe okamžitě pomýšlí na odvolání, Gerry už ale justici nevěří. Mezitím je zatčen jistý Joe McAndrew z Belfastu, který se při výslechu přizná k celé řadě teroristických činů, pod nimiž je podepsána IRA, a to včetně krvavého atentátu, za který pyká Gerry a jeho druzi. Vyšetřovatelé a žalobce Dixon přesto neudělají nic, co by vedlo k propuštění nevinně vězněných, protože nechtějí ztratit tvář... Gerry se ve vězení sbližuje s Joem, přestože jeho otec - jakmile se mu Joe přizná k atentátu - se od něj okamžitě distancuje. Gerry si našel i jinou pochybnou společnost a bere drogy. Otec se trápí a jeho zdravotní stav se zhoršuje. V té době začne do vězení docházet advokátka Gareth Peirceová, která oběma Conlonovým nabízí pomoc. Zároveň je však také příběhem budižkničemu, flákače a podvodníka, který po čtrnácti letech vychází z vězení jako čestný a zásadový muž, připravený čelit životu a nést zodpovědnost.

Politické drama režiséra Jima Sheridana Ve jménu otce se zabývá známým případem tzv. Guilfordské čtyřky. Po atentátu IRA na hospodu v Guilfordu v roce 1974, při němž bylo pět mrtvých a několik desítek těžce raněných, což mělo za následek tvrdá opatření proti terorismu, byli ze zločinu obviněni a odsouzeni čtyři mladí lidé a sedm dalších obžalovaných (včetně dětí) dostalo vysoké tresty za spoluúčast. Až patnáct let po vynesení rozsudku byla v odvolacím soudu pod tlakem veřejného mínění kauza zrušena, ale úplné spravedlnosti nebylo a ani nemohlo být učiněno zadost. Snímek vznikl na základě autobiografické knihy hlavního z odsouzených, Gerryho Conlona, Prokázaná nevina. Ve vyprávění protagonisty se odvíjejí události tak, jak je líčí na kazetě své zástupkyni u odvolacího soudu, advokátce Gareth Peirceové, která měla později hlavní zásluhu na osvobozujícím rozsudku. Jsou tu zachyceny události před atentátem, zadržení domnělých pachatelů, soudní proces, pobyt ve vězení a konečně vítězný odvolací soud. V centru stojí vztah Gerryho k jeho otci, který byl odsouzen spolu s ním a žil s ním v jedné cele, ale který se bohužel svobody nedočkal. Otec jako věřící irský katolík dodržoval zásady Písma a těžce nesl, že jeho syn byl lehkomyslný flákač a zloděj. Generační a rodinný střet je ovšem provázen závěrečným smířením. Film sice jednoznačně odsuzuje praktiky IRA, ale zároveň předkládá jako objektivní fakta tvrzení, jež mohou být zpochybňována. Vychází jen ze subjektivního pohledu oběti a místy až zbytečně démonizuje policejní zvůli. V zásadě však klade důraz na obecně lidské hledisko, prezentované obtížným bojem proti nespravedlnosti.